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茶树高密度遗传图谱构建取得重要进展
作者:马建强      来源:改良中心     发布日期:2015-06-11     点击:      【字号:    

  遗传图谱既是茶树遗传研究的重要手段,又是加速茶树分子标记育种的有力工具。长期以来,由于作图群体类型和分子标记数量的限制,已构建的茶树遗传图谱在标记密度、基因组覆盖度等方面都有待提高。近日,我所茶树种质资源创新团队构建了首张茶树高密度遗传图谱。该团队采用简化基因组测序技术对一个F1全同胞家系进行高通量测序,获得了101091个高质量的序列标签,随后通过基因型编码开发出18846个SNP标记,剔除亲本信息缺失、完整度过低和不适合该群体作图的多态性标记后,获得6042个可用于构建图谱的SNP标记,并联合406个SSR标记构建了包含15个连锁群、3973个位点(包含1470个bin和2543个单标记)、总图距3965 cM、标记间平均距离为1.0cM的高密度遗传图谱。同时,通过等位基因和合子偏分离检验还发现,该作图群体中81.5%偏分离标记是由配子选择引起的,4.9%由合子选择导致的,10.0%由配子和合子共同选择导致的。研究结果在最近一期《PLoS One》(《公共科学图书馆-综合》)(doi:10.1371/journal.pone.0128798)上发表。

  该研究构建的高密度遗传图谱为进一步开展茶树QTL精细定位、基因图位克隆和分子标记辅助育种等研究提供了平台。该研究得到了国家自然科学基金、现代农业产业技术体系、中国农业科学院科技创新工程、浙江省农业新品种选育重大科技专项等项目的支持。

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图1 遗传图谱信息统计

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图2 连锁群标记位点分布情况

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图3 偏分离标记类型和分布模式

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