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茶树液相芯片助力茶树分子育种
作者:刘丁丁      来源:改良中心     发布日期:2025-07-08     点击:      【字号:    

茶叶是世界上种植规模最大、消费人群最广的饮料植物之一。随着茶树育种从常规技术走向智能设计育种,掌握种质资源的基因信息、使种质资源真正发挥种业创新的“芯片”作用,已成为世界各国茶树育种的主攻方向。

近日,我所茶树种质资源创新团队牵头研制了首张茶树TEA5K液相芯片,并利用其完成了茶树品种鉴定、茶树遗传图谱构建、茶树关键农艺性状的QTL定位,以及茶树遗传进化分析等研究工作。相关研究成果以“TEA5K: a high-resolution and liquid-phase multiple-SNP array for molecular breeding in tea plant”为题在国际知名期刊Journal of Nanobiotechnology上发表。

研究基于靶向测序基因分型(Genotyping by Target Sequencing, GBTS)技术,首先对我国200多个主要茶树育成品种进行了基因型检测,结果显示同一品种内的遗传相似度在 92.53% 以上,而不同品种间的遗传相似度均低于 82.36%,这为设定阈值实现茶树品种的准确鉴别留下了充足空间。随后课题组利用该芯片,构建了一张包含3274个SNP标记,总图距长2225.19cM的遗传图谱,并利用该图谱定位了茶树氨基酸组分相关的多个QTL位点,以及与‘黄金芽’品种白化叶色变异相关联的两个紧密连锁的分子标记。最后,课题组利用该芯片对519份茶树种质资源的群体结构和系统发育关系进行了分析,结果表明,现代栽培品种的遗传多样性低于地方资源,此外野生资源与现代栽培品种之间也存在显著的遗传分化,这为我们今后充分利用野生茶树改良现代品种提供了理论依据。

我所在读博士生刘丁丁和已毕业博士生张晨禹为论文的共同第一作者,马春雷研究员、陈亮研究员、陈杰丹副研究员为共同通讯作者。研究得到了国家重点研发计划、江西省人才计划、浙江省农业新品种选育重大科技专项、浙江省自然科学基金重点项目和中国农业科学院科技创新工程等项目的资助。

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