中国农业科学院茶叶研究所农产品质量安全研究中心由农产品质量安全检测室和化学生态实验室组成。中心拥有一支以中国工程院陈宗懋院士领衔的人才队伍，现有高级职称人员6人，中级职称人员4人，其中博士5人，硕士3人。
中国农业科学院茶叶研究所农产品质量安全检测室是经浙江省技术监督局计量认证的食品检验机构，也是农业部认证的农药登记残留试验单位。从事茶叶中农药残留、重金属检测，茶叶及农产品中的农药登记残留试验，并开展对农药残留、助剂、重金属、环境有害物质的风险评估研究。
实验室仪器设备先进，有Waters UPLC/APGC/UPC2 Xevo G2-S QTOF-MS超高效液相色谱/气相色谱/合相色谱/高分辨质谱联用仪，Waters UPLC-Quattro Premier XE Tandem MS/MS超高效液相色谱-串联质谱，Varian 300 GC-MS/MS气质质联用仪, SHIMADZU GPC-GC-MS QP2010凝胶色谱-气相色谱-质联用仪，IRIS/AP电感耦合等离子体光谱仪，Agilent 7890N-Sniffer气相色谱-昆虫触角点位测定联用仪, 以及气相色谱、液相色谱、半制备液相色谱等先进仪器设备多台。
中国农业科学院茶叶研究所农产品质量安全检测室自1996年起承担我国出口茶叶的农药残留委托检测任务，2002年2月，作为我国唯一的实验室，获得欧洲茶叶技术委员“出口欧洲茶叶农药残留检测实验室”的资质认可。2007年、2011年两次通过了英国FAPAS（食品检测分析能力评估体系）的茶叶中农药残留能力测试。可为出口企业提供优质、高效的检测服务。
中国农业科学院茶叶研究所农产品质量安全检测室长期从事农药登记残留试验和农药残留研究。制定了20余项农药合理使用准则和MRL国家标准，2010年，制定了国际食品法典中硫丹在茶叶中的最大残留限量（MRL），实现了我国在国际食品法典限量标准制定零的突破，2012年制定了国际食品法典中氯氰菊酯在茶叶中的最大残留限量（MRL）。这些国际标准的制定，使我国茶业避免遭受新的贸易壁垒，带来良好的社会效益和经济效益。
中心还包括茶树害虫化学生态学的研究。化学生态实验室建立于九十年代后期，主要致力于茶树—害虫—天敌三重营养间的化学通讯机制和植物激素诱导茶树抗虫性两个方面的研究，已明确茶园主要害虫诱导茶树挥发物的特征指纹图谱、指纹性挥发物的主要生态功能、虫害诱导挥发物对害虫及天敌行为的调控机制以及植物激素诱导茶树产生抗虫性的生理生化机制。目前，正在进行植物激素诱导茶树抗虫性的分子机理以及指纹性挥发物合成途径方面的研究，同时正在将诱导抗虫性方面的研究成果转化成产品，在茶园中推广应用。
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